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百迈客基因组测序,强势来袭

2016-08-30 13:54:18 来源:大智博通

  2016年8月15日,《自然-遗传学》(Nature Genetics)杂志在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武研究组和北京百迈客生物科技有限公司合作的最新研究成果。该研究最主要的成果是国际上首次发现全基因组三倍化事件是导致芸薹类物种的形态型多样化以及趋同驯化的原因;此外挖掘出两个重要的商业性状——叶片结球性状和块茎形态性状的重要调控基因,为今后的分子育种工作提供遗传基础。

  基因组组装时基因组研究项目中的核心,而传统的组装手段,很难得到高质量的基因组。基因组测序是物种研究的基础。基于基因组测序的分析功能研究、进化研究和比较基因组学研究,对于研究物种的功能,进化,遗传育种,改进物种性状有重要的作用。基因组研究中组装是最为重要的一步。目前大多数的基因组项目组装采用的仍然是二代小片段数据,常用的组装方法也大多利用图论的方法解决组装难度较高区域。然而对于基因组中的高杂合、高重复和高GC含量的区域,传统的测序技术和组装方法难以高效解决,严重的限制了基因组相关的研究。

  2015年百迈客生物引入三代测序技术、光学图谱技术和Hi-C挂载染色体测序技术,彻底解决组装难题。三代测序技术测序长度在10-20k左右,能直接跨过二代难组装的区域,能准确的提升基因组的完整性。而三代光学图谱利用全基因组拍照定位技术能够将组装的结果进一步提升,能够显著的提升各项指标。而Hi-C技术通过染色体之间的互作,能够将序列直接挂载到染色体水平。因此三代、光学、Hi-C通力合作,能够将基因组组装水平显著提升。目前拥有全部三项技术的公司不多,百迈客生物在基因组测序平台和技术上,已经走在了行业前沿。百迈客生物科技引领contig 组装N50进入M级别,硬实力又有升级。

  拥有最新的全面的测序平台上解读基因组的基础,更需要的是经验丰富的技术团队。

  百迈客人深耕基因组领域长达7年,其中不乏精彩的成果和文章,最近这两篇高水平的文章发表,更彰显了百迈客人深厚的实力和刻苦的钻研精神。目前在线的动植物基因组项目物种比较丰富,形式也很多样。复杂基因组占多数,组装结果均超过了国际标准水平。开发的二代软件GNOVO有很好的组装效果,同时新的三代软件研发已经有突破性进展,可以很大的提升植物基因组重复序列的组装效果。

  领先的技术平台、丰富的技术分析和项目经验,百迈客人仍然不忘初心,朝着打造中国标志性生物企业的方向迈进。百迈客生物科技,为世界创造无限可能。

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编辑:博通

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